AlphaFold es un sistema de Inteligencia Artificial desarrollado por DeepMind que predice la estructura 3D de una proteína a partir de su secuencia de aminoácidos. A través de la experimentación, logra regularmente una precisión muy competitiva.
DeepMind y el EMBL European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) se asociaron para crear AlphaFold DB, poniendo estas predicciones a disposición de la comunidad científica de forma gratuita. La última versión de la base de datos contiene más de 200 millones de entradas y una amplia cobertura de UniProt, el depósito estándar para secuencias y anotaciones de proteínas. Proporciona descargas individuales para el proteoma humano y para los proteomas de otros 47 organismos clave importantes en la investigación y la salud global. También proporciona una descarga para el subconjunto curado manualmente de UniProt (Swiss-Prot).
Cada dos años, desde 1994, las últimas versiones de los sistemas más avanzados compiten entre sí en el concurso de predicción del plegamiento de proteínas CASP (Critical Assessment of protein Structure Prediction), AlphaFold fue el método de predicción de estructura de proteínas mejor clasificado por un amplio margen, produciendo predicciones con alta precisión. Si bien el sistema todavía tiene algunas limitaciones , los resultados de CASP sugieren que AlphaFold tiene un potencial inmediato para ayudarnos a comprender la estructura de las proteínas y avanzar en la investigación biológica.
